L'OMS définit la santé environnementale comme les aspects de la santé humaine qui sont déterminés par les facteurs physiques, chimiques, biologiques et sociaux de l'environnement. Elle concerne également le contrôle et la prévention des facteurs environnementaux susceptibles d'affecter la santé des générations actuelles et futures.

Au niveau national, les risques sanitaires ont fait l'objet d'un plan : le PNSE 2 ou « plan national santé environnement ». Ce plan décline les engagements du Grenelle de l’environnement, en matière de santé-environnement.

Il a pour ambition de donner une vue globale des principaux enjeux et de caractériser et de hiérarchiser les actions à mener pour la période 2008-2013, sur la base d’un constat commun. Il définit un ensemble d’actions, tant au niveau national que local autour de deux axes clés :

• la réduction des expositions responsables de pathologies à fort impact sur la santé ;
• la réduction des inégalités environnementales liées à  l’âge, à  l’état de santé de chacun,  au contexte  socio- économique  ou  encore  à  la  zone  géographique  d’habitation. 

En Franche-Comté, les risques sanitaires liés aux facteurs environnementaux ont fait l'objet d'un travail important dans le cadre de l'élaboration du Plan Régional Santé-Environnement 2 (PRSE2). Ce dernier, qui couvre la période 2011 – 2015, a mis l'accent sur 4 axes :

• « réduire les risques sanitaires liés aux usages de l'eau »,
• « réduire les expositions aux polluants en milieu clos à fort impact sur la santé »,
• « réduire les expositions aux polluants de l'air à fort impact sur la santé »
• « réduire les risques de maladies chroniques en agissant sur l'alimentation ».

Quatre sources de risques sanitaires liés à l'environnement sont mises en avant : le gaz radon, les sols pollués par des substances radioactives, les risques sanitaires liés à l'eau et les pollens de plantes potentiellement allergisantes.