Plusieurs directives européennes visent à rendre plus transparentes les initiatives en matière d’environnement : convention d'Aahrus, directive Inspire (loi de mise à disposition du public)…
Dans ce sens, le développement des outils informatiques et la généralisation d’internet permettent de mettre en place des modalités d'accès facilitées aux données environnementales. Cette mise à disposition plus aisée envers tout type de public apparaît comme un enjeu majeur, permettant à tout un chacun (élus, acteurs socio-économiques, population) de disposer des données nécessaires pour décider ou prendre position par rapport à un projet territorial. En effet, la prise de décision nécessite concertation et gouvernance adaptées dans de multiples domaines : urbanisme, eau, transports et déplacements, gestion des espaces naturels, prévention des risques etc.
Néanmoins avant de diffuser la connaissance, le premier obstacle consiste à mutualiser des informations souvent très éparses. Plusieurs démarches en ce sens ont été engagées en Franche-Comté. Notamment la plateforme SIGOGNE, portail de la description de la biodiversité en Franche-Comté qui, au-delà de l'outil informatique, s'appuie sur un très large partenariat et regroupe la très grande majorité des données naturalistes régionales. Dans la même logique, la région Franche-Comté propose un outil performant : l'observatoire territorial énergie-climat-air (OPTEER) qui permet également de mutualiser l'ensemble des données sur la qualité de l'air, le climat régional ou encore les données énergétiques locales.
Enfin, le profil environnemental Franche-Comté mis en oeuvre par la DREAL constitue en soi un outil de mutualisation et de diffusion des connaissances accessible au plus grand nombre.