La Franche-Comté présente des paysages variés et de grande qualité, associés à un cadre de vie très prisé, en premier lieu par ses habitants mais aussi pour les activités touristiques en lien avec les espaces naturels.

Ces paysages subissent des pressions ponctuelles qui altèrent avec le temps leur qualité globale. Des éléments caractéristiques comme les dolines ou les murgers, traces des pratiques agricoles anciennes, disparaissent petit à petit. La lutte contre la banalisation des paysages liée à l'évolution des milieux agricoles ou des espaces urbains doit donc être au cœur des politiques publiques régionales.

Ainsi, les efforts en terme de protection et de gestion des paysages au travers des mesures de type sites classés, sites inscrits ou grands sites paysagers doivent être poursuivis mais ne sont plus suffisants.

La préservation et la valorisation des paysages francomtois doivent également être intégrées dans les démarches globales d’aménagement du territoire. Cela passe entre autres par la bonne gestion des périphéries urbaines (interfaces ville/nature) : maintien des vergers, ceintures vertes…, le développement des espaces verts urbains et la préservation des grands secteurs agricoles régionaux, composante essentielle de la qualité globale des paysages.

Ces différents éléments doivent trouver écho dans les projets régionaux, que ce soit les grands projets de territoire, les projets d'aménagements, les projets urbains locaux de type ZAC, ou encore les projets touristiques.

Pour être efficace et vécue comme un atout et non comme un frein, la préservation des paysages doit être dynamique et passe par une réflexion sur les conflits d'usages liés à un même secteur ou à une même ressource. Les besoins d’aménagement urbain notamment, doivent être pris en compte mais les aménagements à venir doivent s’inscrire dans une perspective de respect et d’intégration à la qualité globale des paysages.