La préservation par des espèces naturelles passe par la préservation de leurs milieux.

De nombreuses procédures de préservation existent mais toutes n’ont pas les mêmes objectifs ou les mêmes leviers : réglementation, gestion, protection du foncier.

Le calcul final de l'indicateur exclu la part de territoire en parc naturel régionel (PNR) car les PNR ne sont pas des outils de préservation ou gestion des milieux.

La Stratégie Nationale de création d'Aires Protégées (SCAP) actuellement menée a pour mission de "stopper la perte de biodiversité" en protégeant de nouveaux milieux et espèces. Aussi les surfaces bénéficiant d'une gestion ou d'une protection devrait être de plus en plus nombreux.